Prostatos vėžys: dideli duomenys atranda 80 naujų narkotikų taikinių
Didžiausiame prostatos vėžio genetikos analizės tyrime mokslininkai randa ne mažiau kaip 80 naujų galimų narkotikų taikinių. Projektas atveria plačias galimybes kurti naujus gydymo būdus.
Genetinių duomenų išskyrimas kažkada buvo sudėtinga ir nepaprastai daug laiko reikalaujanti užduotis.
Tačiau technologijoms tobulėjant, darbas tapo žymiai greitesnis ir pigesnis.
Tuo pat metu labai patobulėjo įrankiai, skirti tvarkyti didelius duomenų rinkinius.
Kartu tai reiškia, kad iš genetinio kodo surinktus informacijos vandenynus galima analizuoti, susieti ir palyginti lengvai derinti, kad būtų užtikrintas naujas aiškumo lygis.
Neseniai tarptautinė komanda naudojo šį dvigubą DNR analizės metodą ir didelius duomenis, kad įsigilintų į prostatos vėžio genetiką. Medžiojant molekulinius chinkus ligos šarvuose, tyrimą organizavo Vėžio tyrimų institutas Londone, Jungtinė Karalystė.
Prostatos vėžio iššūkiai
Prostatos vėžys yra antras dažniausias vėžys tarp vyrų JAV. Šiais metais JAV bus apskaičiuota 164 690 naujų prostatos vėžio atvejų ir beveik 30 000 šios ligos mirčių.
Nors mokslininkai pažengė į priekį suprasdami ir gydydami prostatos vėžį, vis dar yra nemažai sunkumų.
Kaip paaiškina tyrimo vadovas prof. Rosalindas Eelesas: „Vienas iš iššūkių, su kuriais susiduriame atliekant vėžio tyrimus, yra ligos sudėtingumas ir daugybė būdų, kuriais galėtume ją gydyti“.
Daktarė Justine Alford, iš vėžio tyrimų, JK, apibūdina kitą prostatos vėžio tyrimo ir intervencijos problemą.
„Pagrindinė kliūtis siekiant tolesnės pažangos kovojant su prostatos vėžiu, - aiškina ji, - trūksta būdų, kaip tiksliai numatyti, kaip progresuoja žmogaus liga, todėl sunku žinoti, kuris gydymas yra geriausias kiekvienam pacientui“.
Genetinių duomenų rinkimas
Norėdami spręsti problemą nauja linkme, mokslininkai paėmė genetinę informaciją iš 112 vyrų, sergančių prostatos vėžiu, ir sujungė ją su daugelio kitų tyrimų duomenimis. Iš viso buvo naudojami 930 pacientų mėginiai.
Naudodama naujausius didžiųjų duomenų metodus, komanda įgijo naujų įžvalgų apie genetinius pokyčius, kurie paskatina prostatos vėžio vystymąsi ir skatina jo progresavimą. Supratę, kurie genai yra susiję, jie galėjo sukurti baltymų, kuriuos koduoja šie genai, žemėlapį.
Tada jie kreipėsi į duomenų bazę, vadinamą „canSAR“, kuri sujungia tyrimų duomenis, taiko mašininį mokymąsi ir padeda įžvalgų apie vaistų atradimus.
Savo svetainėje „canSAR“ paaiškina klausimus, į kuriuos siekiama atsakyti jų duomenų bazėje: „Kas yra žinoma apie baltymą, kuriame vėžys yra išreikštas ar mutavęs, ir kokius cheminius įrankius bei ląstelių linijų modelius galima eksperimentiškai ištirti jo aktyvumą? Kas yra žinoma apie vaistą, jo ląstelių jautrumo pobūdį ir kokius baltymus jis jungiasi, kurie gali paaiškinti neįprastą biologinį aktyvumą? “
Mokslininkai nustatė, kad 80 jų aptiktų baltymų buvo potencialūs narkotikų taikiniai. 11 iš jų buvo skirti esamų vaistų, o septynioms kitoms - jau klinikinių tyrimų metu.
Jų išvados šią savaitę skelbiamos žurnale Gamtos genetika.
„Mūsų tyrimas naudojo pažangiausias didelių duomenų analizės metodikas, kad gautų daug naujos informacijos apie prostatos vėžį ir galimus kovos su šia liga būdus.“
Prof. Rosalind Eeles
Žvilgsnis į ateitį
Aišku, kad juos būtų galima kliniškai naudoti, be abejo, reikės papildomų tyrimų, tačiau jie suteikia daugybę naujų galimybių.
Kaip paaiškina bendraautorius prof. Paulas Workmanas: „Šis tyrimas atskleidė nepaprastai daug naujų genų, skatinančių prostatos vėžio vystymąsi, ir suteikė mums gyvybiškai svarbios informacijos apie tai, kaip panaudoti ligos biologiją, norint rasti galimų naujų gydymo būdų. “
Jis tikisi, kad jų darbas „paskatins naujų genetinių pokyčių ir galimų vaistų, kuriuos jie nustatė, tyrimų bangą, kad pacientai kuo greičiau turėtų naudos“.
Kitas kliūtis kuriant prostatos vėžio gydymo būdus yra tai, kad liga progresuoja skirtingai kiekvienam asmeniui. Dėl to daug sunkiau nuspręsti, kurios gydymo galimybės geriausiai tinka kiekvienam pacientui.
Daktaras Alfordas tikisi, kad „[labai] geriau suprasdami ligos genetiką, [...] ateityje šios žinios galėtų padėti gydytojams geriau pritaikyti asmens vėžio gydymą ir, tikiuosi, pamatyti daugiau žmonių, išgyvenančių dėl savo ligos. “
Tai ankstyvos dienos, tačiau naujos kartos tyrimų išvados gali pakeisti šią sritį.
